气功治病的基本原理是强调调身、调息、调心，强调“意气合一”。气功能以意念指导放松、以意念诱导入静、以意念调整大脑和皮层下各级神经中枢的功能。气功既可通过脑和神经系统，也可直接作用于各组织系统、器官乃至细胞;气功的独到之处就是意念的引导，由于意念具有正向信息作用，从而使整体功能趋向于高度协调、高度序化、高度激发的状态。气功的强身功效卓著，全身强健，容貌自然更加健美亮泽。气功可发挥良好的整体运行效果，使人体似日月、似自然、动静适合，运化自然，去病强身。
佛教中虽无相当于本来意义的“气功”，但从现代广义的气功而言，在客观上瑜珈和禅修中都包含有类似气功的内容。
瑜珈，是梵文YOGA的音译，在佛典中汉语意译为“相应”，指控制自己身心令与某种东西相应（相契合，一致）。瑜珈是古印度各宗教对自我调制以锻炼身心的功夫的统称，佛教亦称其禅定为瑜珈。修禅定者被称为瑜珈行者，或瑜珈师。佛教密宗的修练方法更多以瑜珈命名。在印度，至今仍将各种修练方法统称为瑜珈，不过有了一些变化，有多种精神内涵和锻炼姿势。近年来，由于它具有调节身心的特点，在世界上引起了重视，尢以欧美为甚。
禅修是指禅定的修习。禅为梵文“禅那”（DHYANA）的简称，汉译“静虑”、“思维修”，指在寂静的心态下思虑。定为梵文三昧（SAMADHI） 的意译，指摆脱散乱、昏沉的一切寂定心境。禅定合称是对佛教各种瑜珈的通称。需要指出的是，禅宗的“明心见性”功夫也被称为“禅”，有其特殊含义。禅修是佛家的一种修练方法，是指在安静的环境和正常的生活中，放下一切不必要的樊缘和杂念，集中精神，进行不断的修习。
气功与瑜珈术、禅修有很多共同点，比如，两者都是自我心身锻炼的方法，要求用调身、调息、调心的方法结合起来修习，以达到入静状态，使人在精神和智慧上获得多种益处，都能祛病健身，涵养道德，陶冶性情，并把它作为人们认识自身生命运动的新途径。虽然他们之间有很多一致性，但总的看来，气功与瑜珈术、禅修等仍有质的不同。气功研究的目的，在各阶段始终立足于现实人生，以使人类得到现实利益为宗旨。气功锻炼的目的，一般在于健身治病，养生益智，陶冶性情等。佛教徒修习瑜珈术、禅修的目的在于获得大智慧，摆脱烦恼，“了却生死”。至于防病、健身，只不过是修习过程中获得的副产品。同时，二者意守之境即“观”也不同，气功中意守多为有益于健康的某些景，而瑜珈、禅修所意守的都是会有一定宗教性的内容，例如念佛等。在佛教徒看来，一个人为治病健身延年，花费许多时间去练气功，不知佛家止观以了生死，是“拿金条当稻草使”。可见，人们练气功静坐与佛教徒禅修，从外表、方法上看起来无多大区别，但其主观信念却有质的不同。
